从1999年研究科技园区开始，对科技创新的系列重大问题进行了持续研究，在科技创新平台建设、企业技术创新等方面进行了卓有成效的研究。早在2000年主持完成的“福建留学人员创业园战略规划”，成果获时任常务副省长批示,为“福建留学人员创业园十五计划与2010年规划（纲要）”采用。规划稿在香港《大公报》发表。2004年开始，我所郑庆昌教授主持并带领研究团队，持续开展科技创新平台建设相关研究，主要代表性成果如下：
1、科技基础条件平台与共享机制建设研究
2004年，为贯彻落实《2004-2010年国家科技基础条件平台建设纲要》，我所郑庆昌教授主持完成福建中长期科学和技术发展规划战略研究专题“科技基础条件平台与共享机制建设研究”。研究成果首次提出福建要“建设由科技资源共享平台、技术研发协作平台、成果转化促进平台、科技中介服务平台（含产业公共技术服务平台）等四大平台组成的科技平台系统。成果2006年，获《省科技发展第十一个五年规划纲要》、《省中长期科学技术发展规划纲要》、《省国民经济和社会发展第十一个五年规划纲要》等省政府文件采用。
2、创新能力基础设施研究
该成果系2005年主持完成的省发改委十一五规划项目“创新能力基础设施研究”的研究成果。成果提出围绕全省高技术产业及集群化发展的需要，十一五期间需要重点建设一批工程研究中心、工程实验室、企业技术中心、科技企业孵化器和高技术产业公共技术服务平台等创新能力基础设施，提升全省自主创新能力和高技术产业的核心竞争力。成果获省政府文件《福建省“十一五”高技术产业发展专项规划》采用实施。
3、福建省产业公共技术服务平台建设研究
2007年主持完成省经贸委项目，研究成果《福建省产业公共技术服务平台建设研究》。成果对产业公共技术服务平台的内涵与功能进行了界定，着重提出了福建省产业公共技术服务平台建设的总体思路，强调：以提高企业的自主创新能力、提升产业技术水平为主线，根据我省主导产业、重点培育发展的高新技术产业、有竞争优势的传统产业，以及产业集群对共性技术和关键技术的需求，在中小企业比较集中和具有产业集聚优势的地区，依托有关重点实验室、工程（技术）研究中心、企业技术中心以及科技企业孵化器等科技中介机构，重点建立一批产业公共技术服务平台。2007年研究形成《成果要报》提交省领导参阅。
4、高校科技创新与转化平台建设工程研究
该成果系主持完成的2007年福建省教育厅科技专项“福建高校科技创新与转化工程”研究成果。成果分产业对我省高校科技创新与转化的需求切入分析，提出了“以服务为宗旨，以需求为导向，以创新与转化为主线”的“福建高校科技创新与转化工程”建设方案的总体思路、各领域专项和任务等。该成果提交教育厅、获省决策，由闽教高〔2008〕75号发布实施。
5、闽台科技型中小企业投融资服务平台研究
2009年，完成科技部创新基金项目“闽台科技型中小企业投融资服务平台研究”3个子课题：闽台科技型中小企业投融资服务平台运行机制、专家系统方案设计、管理咨询系统方案设计等三个子课题，获科技部验收结项，已运行使用。
6、福建省农业科技创新平台建设规划
2008年，主持完成福建省科技厅农业处项目“福建省农业科技创新平台建设规划”。研究成果以领域和平台类别交织分析，摸清平台基础和需求，在此基础上提出了“一条主线，两个导向，三种能力，四个重点，五个统筹”的建设思路和拟建平台项目。成果获省科技厅决策采用。
7、福建省科技创新平台建设规划
2008年，该成果系省科技厅委托项目“福建省科技创新平台建设规划（2008-2010）”的研究成果。成果提出以科技资源的整合、集成、共享，提升产业技术创新水平与区域科技公共服务能力为主线和重点，着力建设一批重点实验室，增强产业技术的源头创新能力；着力建设一批工程技术研究中心，加快产业技术的转化；着力建设一批科技创新公共服务平台，增强产业技术创新的公共服务能力。成果获科技厅采用、实施。
8、科技创新能力及创新平台建设研究
该成果系2010年主持完成的省“十二五”科技发展规划战略研究专题“科技创新能力及创新平台建设研究”成果。成果以“平台建设与科技、经济社会发展需求对接，做实做强已有平台，着力集成提升构建科技创新大平台”为核心思路，提出一是要构建支撑产业技术重点跨越的省级重大科技创新平台。二是推进科技成果转化、科技中介服务和科技资源共享平台建设。三是建立完善运行有效的共建共享机制。该成果首次提出了建设重大创新平台。2011年，成果获省政府文件采用，获第九届省社科优秀成果三等奖。
9、重大科技创新平台建设研究
该成果系2012年完成的福建省软科学指定项目“重大科技创新平台建设研究”成果。成果围绕重大科技创新平台怎么建和如何运行的关键问题，着重提出了重大科技创新平台建设的总体思路和启动建设与试点、重大科技创新平台建设与运行的体制机制与管理办法，以及保障措施。成果主要观点已为省十二五规划编制、省科技厅制定重大科技创新平台相关政策提供决策参考。
10、晋江市科技创新公共服务平台规划
2012年，主持完成“晋江市科技创新公共服务平台规划”。规划在梳理晋江市科技创新平台建设现状、产业科技创新需求基础上，提出晋江市科技创新公共服务平台建设的总体思路、体系架构和建设重点和五大平台建设运行机制。规划延续成果2013年获报送省委书记、省长等省领导参阅。
11、福建省关于中小企业公共技术服务机构补助项目年度实施方案
2013年，主持完成“福建省关于中小企业公共技术服务机构补助项目年度实施方案”。成果获省科技厅采用、实施。
12、企业科技创新平台评价指标体系研究——以企业工程技术研究中心为例
2014年，主持完成“企业科技创新平台评价指标体系研究——以企业工程技术研究中心为例”，成果基于导向性、系统性、可比性和实用性等评价指标体系构建原则，从创新投入、创新能力和创新管理等3个基本维度，构建了福建省企业工程技术研究中心绩效评价指标体系，已提交结项。
目前，福建农林大学软科学研究所的科技创新平台研究团队持续开展科技创新平台研究，包括正主持省政协调研项目“我省重点产业科技创新平台建设研究”、省软科学重点项目“重大科技成果、高水平研发机构落地转化的政策研究”等。
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